Padre Vladimir nasce nel governatorato della Livonia. Conclude gli studi presso l’Accademia teologica ortodossa di San Pietroburgo. Nel 1910 è ordinato sacerdote ortodosso. Nel 1913 viene confinato nel monastero delle Grotte di Kiev per le sue simpatie verso il cattolicesimo. Nel 1924 passa al cattolicesimo di rito orientale. Dal 1925 esercita il ministero nella chiesa cattolica di Brailov, distretto di Vinnica. Dal febbraio 1926 è vicario a Sharovka, governatorato di Cherson, e dal 21 agosto vicario di Cherson. Dal settembre 1926 è amministratore della diocesi cattolica di rito latino di Cherson.
Nel febbraio 1930 è arrestato ed accusato di aver ricevuto denaro dall’amministratore apostolico Avgustin Baumtrog, ma viene messo in libertà dopo breve tempo. Nel 1936 è nuovamente arrestato come “membro di un’associazione controrivoluzionaria”. Il 21 aprile 1936 è condannato dal tribunale di Odessa a 7 anni di lavoro correzionale.
Padre Vladimir Klepfer muore nella prigione di Odessa il 4 maggio 1936.